ペプチド-配列決定と合成

ペプチドの配列が得られたら、その合成に注意を向けることができます。 ペプチドの合成には、解決すべき2つの問題があります。 1つは、ペプチド結合を作成する方法を開発することです。この方法では、ペプチド内の他の何も損傷しません。 これは、2つのアミノ酸の「カップリング」と呼ばれます。 もう1つは、適切な順序でアミノ酸がペプチドに追加されるようにすることです。

最初の問題の鍵は、O-アミノ酸のカルボン酸基をより良い脱離基に変換することです。 OHをClに変換して、反応性のアシルクロリドを作ったとき、似たようなものを見てきました。 これは、ジシクロヘキシルカルボジイミド、または略してDCCと呼ばれる試薬を使用して行われます。 DCCは、Oに結合することで機能し、それを適切な脱離基に変換します。多くの電気陰性原子があるため、脱離時に負電荷の安定化に役立ちます。 良い脱離基を持つアミノ酸は「活性化された」と言われています。

実際のカップリング反応は、配列の「右側」にあるアミノ酸のアミノ基が「活性化された」アミノ酸のカルボニル炭素を攻撃し、DCCが結合している酸素とともに離れるときに起こります。 いつものように、物事を片付けるにはいくつかのプロトンシフトが必要です。

2番目の問題は、Ala-Glyなどのジペプチドの合成を検討することで、目的の配列にアミノ酸を追加することです。 単純に等量のグリシンとアラニンを混合してDDCカップリング反応を実行すると、グリシンがグリシンと反応してGly-Glyを生成し、アラニンがアラニンと反応してAla-Alaを生成し、グリシンが2つの方法でアラニンと反応しますAla-GlyとGly-Ala。 これは混乱であり、より具体的なアプローチを開発する方が良いでしょう。